Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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UBXN4Q92575 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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