Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms