Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HS2ST1Q7LGA3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms