Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC025268.1-201ENST00000632192 1199 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC006064.1-201ENST00000499202 560 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC066613.2-201ENST00000561007 560 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.135-201ENST00000616324 269 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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