Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms