Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR1P43307 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms