Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms