Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms