Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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