Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.2 ms