Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX5Q9Y5X3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX5Q9Y5X3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX5Q9Y5X3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX5Q9Y5X3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX5Q9Y5X3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX5Q9Y5X3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms