Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGA4Q9Y5G9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms