Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP15Q9Y4E8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms