Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms