Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
THRAP3Q9Y2W1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
THRAP3Q9Y2W1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms