Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms