Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN2Q9UNF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN2Q9UNF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms