Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1RE1Q9UN81 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms