Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF490Q9ULM2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF490Q9ULM2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms