Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
INO80Q9ULG1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms