Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB23Q9ULC3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms