Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSR3Q9UJK0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms