Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
IFT172Q9UG01 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
IFT172Q9UG01 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms