Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EPHA6Q9UF33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPHA6Q9UF33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms