Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMCD1Q9NZU5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms