Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARHGEF12Q9NZN5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF12Q9NZN5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms