Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKD2L2Q9NZM6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms