Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDE1Q9NZC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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