Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DLL3Q9NYJ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms