Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PDS5BQ9NTI5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PDS5BQ9NTI5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC39.26■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.8 ms