Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER3Q9NSC5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms