Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.77■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.76■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DUOX2Q9NRD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
DUOX2Q9NRD8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms