Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST12Q9NRB3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms