Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR9Q9NR96 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR9Q9NR96 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms