Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPHNQ9NQX3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms