Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRA1Q9HD15 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms