Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX8Q9HC52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms