Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRABDQ9H4I3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRABDQ9H4I3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms