Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD1Q9H3U5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD1Q9H3U5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms