Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF541Q9H0D2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms