Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REXO4Q9GZR2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms