Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER1Q9C0I3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER1Q9C0I3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
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