Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRCC1Q9C099 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRCC1Q9C099 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRCC1Q9C099 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms