Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RNF17Q9BXT8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF17Q9BXT8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms