Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM2D3Q9BRN9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms