Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGMNQ99538 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms