Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms