Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC43Q96MW1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC43Q96MW1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms