Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00479Q96M42 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms