Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK3Q96L96 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms